VSSであれば、ホストクライアントやコマンドで再設定すればいいだけですのでVDSと想定しています。
vDSでvCenterとの疎通がなくなるようなネットワーク変更を行った場合はロールバックされる機能がありますので、無効化している場合は有効化しておくほうが無難かと思います。
vSphere ネットワーク ロールバック (vmware.com)
ネットワーク ロールバックを無効にする (vmware.com)
どういった構成なのかが不明ではありますが、vmnicが複数ある場合に汎用的に利用できる対処としてはvDSにアサインされているvmnicを１つ取り外して、そのvmnicをアップリンクとするVSSを新規で作成し、管理VLANを利用するポートグループを作成して、管理用vmkernel portをそのポートグループに作成をしなおせば、vCenterとの疎通が復活しますので、その状態で改めてVDS側のVLANを修正し、管理vmkernel portをVDS側に移行してから、VSSを削除して、vmnicを戻す手順が考えられます。
