Hola,
para esas tareas en sistemas Linux se usa el fdisk. Lo que en windows se hace con el diskpart.
Tanto en las instalaciones de sistemas windows & linux se deben usar alguna herramienta adicional ya que en el proceso de instalación no es posible crear las particiones alineadas.
Desde la perspectiva de filesystem en linux, para una partición que va a alojar ficheros pequeños un tamaño de 32K me parece un poco grande.
Un saludo.
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