Ju,
Você pode transferir o vmdk (juntamente com os outros arquivos, vmx, flat-vmdk, nvram) com WINSCP mesmo, mas recomento também o Veeam que foi comentado acima.
Apos fazer upgrade do hardware e do vmware tools nao tem como voltar mais para o 3.5.
O upgrade de hardware será solicitado quando voce for ligar a maquina, ou clique com o botao direito na Vm que teras essa opcao.
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