vSphere4のAdvanced EditionをインストールしたESXサーバと
Enterprise EditionをインストールしたESXサーバの2台で、
VMotionを実現したいのですが構成として問題はありますでしょうか？

2台のH/W構成は同一となります。

Advance EditionとEnterprise Editionには、
VMotionのライセンスがあるので問題なく実現できるという
認識でおりますが、何か制限などが無いか懸念しております。

宜しくお願いいたします。